1990年から91年にかけて、米国連邦巡回控訴裁判所のアラン・D・ローリー判事のもとでクラークを務めました。1991年にUSPTO特許実務者登録第34,695号を取得し、ニューヨーク州弁護士として認可されました。クラークシップ終了後は、USPTO事務局で弁護士として勤務し、50件の連邦巡回区控訴の口頭弁論を担当し、88件の連邦巡回区準備書面をUSPTOのために作成しました。また、66件の連邦巡回区の控訴審で共同弁護人を務めました。USPTOの弁護士として29年間、数多くの控訴を勝ち取りました。その中には、In re Schreiber（1997年の特許審査の事例で、何度も引用されている）、In re Watts（権利放棄の法理について、USPTOが念願の勝利を収めた）、Zumbiel v. Kappos（複雑なパート間の訴訟）などの重要な控訴が含まれています。Kappos（複雑な当事者間特許再審査請求事件で、ジョーは特定のクレームの特許性と他のクレームの非特許性の両方を主張して成功した）、Shimano v. Rea（複雑な当事者間特許再審査請求事件で、ジョーはクレームの解釈と記述を中心としたPTABの特許性と非特許性の両方の決定について弁護して成功した）などがあります。